Senatas yra aukščiausioji sprendžiančioji Šiaulių universiteto institucija. Senatas, vadovaudamasis Lietuvos Respublikos įstatymais, Šiaulių universiteto statutu ir Senato reglamentu, svarsto ir priima nutarimus studijų, mokslo, finansų, socialiniais ir kitais klausimais, tvirtina studijų programas, renka ŠU rektorių, rektoriaus teikimu tvirtina prorektorius, dekanus bei kitus mokslo ir studijų padalinių vadovus, suteikia darbuotojams pedagoginius ir garbės vardus, tvirtina mokslo krypties doktorantūros komisijas, habilitacijos komitetus, nustato sąlygas darbuotojų kvalifikacijai kelti, sprendžia kitus klausimus, nepriskirtus kitų Universiteto valdymo institucijų kompetencijai. Senato nutarimai įteisinami Rektoriaus įsakymu. Įsigalioję Senato nutarimai privalomi visiems Universiteto darbuotojams ir studentams.

Senatą 5 metams renka Universiteto dėstytojų ir mokslo darbuotojų konferencija. Senatą sudaro 36 nariai: 32 mokslininkai ir 4 Studentų atstovybės deleguoti nariai.
Senato posėdžiai yra atviri visiems Universiteto darbuotojams ir studentams. Senato posėdžiuose gali dalyvauti Universiteto tarybos nariai, spaudos ir kitų informacijos priemonių atstovai. Senatui pritarus, galimas ir kitų asmenų dalyvavimas.

ŠU Senate yra 5 nuolatinės komisijos, kurioms vadovauja jų išrinkti pirmininkai: Atestacijos komisija - pirmininkas prof. K.Župerka, Mokslo ir meno komisija - pirmininkas prof. E.Balčytis, Finansų komisija - pirmininkas prof. T.Tamošiūnas, Studijų komisija - pirmininkas doc. J.Pabrėža, Teisės ir statuto priežiūros komisija - pirmininkas doc. L. Paulauskas. Komisijos svarsto Senatui pateiktus dokumentų projektus ir kitus pasiūlymus. Senato komisijų nutarimai, išvados ir kiti dokumentai yra rekomendacinio, konsultacinio pobūdžio. Komisijų posėdžiai yra atviri.